ウィジェットからサクッとNight Shiftをオンにする
iOS 9.3になると、ウィジェットにNight Shiftのオンオフボタンが追加されます。これでサクッと有効にできます。スケジュールで自動的にNight Shiftをオンにする
画面表示と明るさ > Night Shiftで時間指定をオンにすると、Night Shiftを有効にする時間を設定できます。Night Shiftの色温度を変更する
画面表示と明るさ > Night Shiftの色温度という項目では、Night Shift有効時のディスプレイの色温度を変更することも可能。目をいたわれよってことなんだと思いますが、個人的には時間で急に色変わったらイラっとしそうなので必要に応じてウィジェットから有効にするのが一番よさそうです。